En el año 1988, asumió el cargo de Obispo diocesano monseñor José Trinidad Sepúlveda Ruiz-Velasco, quien impulsó la construcción de la Casa de Pastoral Juan Pablo II y la elaboración y puesta en marcha del segundo (de 1989 a 1995) y tercer (de 1995 al 2000) Plan Diocesano de Pastoral.
El 8 de mayo de 1990, monseñor José Trinidad marcaría la memoria de los fieles de la Diócesis de San Juan cuando, con gran entusiasmo, recibió la visita del ahora Santo, papa Juan Pablo II. Justo en esta etapa se comenzaron a realizar Asambleas a nivel decanal y parroquial.
Murió el 5 de septiembre de 2017.